芳村中心卫生院位于芳村镇芳村村芳鑫北路。辖区内共有14个行政村，服务人口约2.1万余人，常住人口1.2万，主要承担着医疗卫生、疾病预防控制暨公共卫生服务等工作任务。2018年医共体改革后，芳村中心卫生院成为县人民医院芳村分院。

卫生院门诊楼于1982年10月动工新建，1984年8月投入使用，医院建筑面积6050平方米，其中业务用房2613平方米。医院设院办、党办、财务、医务、护理、院感、信息等多个职能科室。设有全科医学科、内科、外科、妇产科、儿科、中医科、康复医学科、口腔科、医学检验科、B超、心电图、放射科、中西药房、药库、手术室（麻醉科）、血液透析室、体检中心、妇保科、儿保科、防疫科等科室。2021年启动芳村中心卫生院整体迁建项目，用地约30亩，按照二级综合性医院标准建设，设计床位200张，其中包含门诊综合楼、公共卫生楼、后勤楼、发热门诊，总建筑面积20000m2。总投资约13700万元，2023年年底投入使用。卫生院设备齐全，配备有救护车一辆，血液透析机、DR、彩超、全自动生化分析仪、血凝仪、自动血液分析仪、心电图机、颈部牵引仪、手术床、麻醉机等设备，为临床工作的开展提供了坚实的保障。

现有在岗职工48人（其中注册临床医生19人，护理13人，药剂4人，医技人员5人（含检验及医学影像），公卫卫生4人，收费2人，后勤1人)。其中高级职称3人，中级职称11人，中级以上职称占比29.16%；医技人员中本科及以上学历36人，占比75%。经住院医师规范化培训并取得合格证4人，中级及以上中医类别医师1人，执业范围注册全科医学医师10人。开设床位30张，2022年年门诊人次6.2万余人，住院人次659人，总业务量1170万。

近几年通过发展特色专科、培养专业技术人才、开展新技术、提升医疗装备水平，不断提高医院综合服务能力和水平。2016年被浙江省卫生和计划生育委员会评为甲等卫生院、2017年被国家卫生和计划生育委员会评为群众满意卫生院。血透、糖尿病、中医科被衢州市卫生和计划生育委员会评为市级特色专科。2020年被浙江省、国家评为优质服务基层行推荐标准。