常山县疾病预防控制中心组建于2000年11月，是政府实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益性事业单位。中心用房总建筑面积3040.5㎡，其中实验用房1300㎡，2023年即将投入使用新疾控大楼及独立的检验大楼。

现设有现有办公室、传防科、特防科、慢病科、健教科、检验科、卫生科等七个科室。核定事业编制46人（含周转编10人），其中在编37人，实际在岗42人。在岗人员中有卫生专业技术人员41人，其中正高职称3人，副高职称3人，中级职称13，初级及以下职称22人；研究生学历2人，本科学历31人。拥有省151人才1名，衢州市151人才1名，县百名优秀人才2名，县卫健系统学科带头人2名。

中心建有PCR核酸检测实验室、艾滋病筛查中心实验室、省级粪检实验室、百级洁净实验室、致病菌实验室、血清实验室等专业实验室;拥有PCR仪、气相色谱仪、离子色谱仪、原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、高温高压微波消解仪、低本底αβ测量仪、万分之一电子天平、紫外分光光度计、固相萃取装置、超纯水器及全自动细菌鉴定仪（包括药敏）等精密仪器设备。

近年来，中心积极引进国家、省、市级项目近30余项，获省疾控中心重点实验室开放项目2项，市级科技立项1项、市“新115人才工程”培养人员科技项目（课题）1项、县级科技立项8项，县科技进步二等奖1项；发表学术论文110余篇，其中在英国情感障碍杂志发表1篇SCI论文，获得市级继教项目3项。 先后获得“ 县卫生系统先进集体”、“县级先进基层党组织”、“县基层满意服务站所”、“县级巾帼文明岗”、“市级文明单位”、“市卫生先进单位”、“ 档案管理省级达标单位”、“省疾控系统政治思想工作先进集体”、“全国伤害监测先进单位”、“省级性病防治先进集体”等荣誉，多名职工受到国家、省、市、县各级的嘉奖。